Spark性能调优

jopen 6年前

原文  http://www.csdn.net/article/2015-07-08/2825160


通常我们对一个系统进行性能优化无怪乎两个步骤——性能监控和参数调整,本文主要分享的也是这两方面内容。

性能监控工具

【Spark监控工具】

Spark提供了一些基本的Web监控页面,对于日常监控十分有用。

1. Application Web UI

http://master:4040(默认端口是4040,可以通过spark.ui.port修改)可获得这些信息:(1)stages和tasks调度情况;(2)RDD大小及内存使用;(3)系统环境信息;(4)正在执行的executor信息。

2. history server

当Spark应用退出后,仍可以获得历史Spark应用的stages和tasks执行信息,便于分析程序不明原因挂掉的情况。配置方法如下:

(1)$SPARK_HOME/conf/spark-env.sh

export SPARK_HISTORY_OPTS="-Dspark.history.retainedApplications=50

Dspark.history.fs.logDirectory=hdfs://hadoop000:8020/directory"

说明:spark.history.retainedApplica-tions仅显示最近50个应用spark.history.fs.logDirectory:Spark History Server页面只展示该路径下的信息。

(2)$SPARK_HOME/conf/spark-defaults.conf

spark.eventLog.enabled true

spark.eventLog.dir hdfs://hadoop000:8020/directory #应用在运行过程中所有的信息均记录在该属性指定的路径下

3. spark.eventLog.compress true

(1)HistoryServer启动

$SPARK_HOMR/bin/start-histrory-server.sh

(2)HistoryServer停止

$SPARK_HOMR/bin/stop-histrory-server.sh

4. ganglia

通过配置ganglia,可以分析集群的使用状况和资源瓶颈,但是默认情况下ganglia是未被打包的,需要在mvn编译时添加-Pspark-ganglia-lgpl,并修改配置文件$SPARK_HOME/conf/metrics.properties。

5. Executor logs

Standalone模式:$SPARK_HOME/logs

YARN模式:在yarn-site.xml文件中配置了YARN日志的存放位置:yarn.nodemanager.log-dirs,或使用命令获取yarn logs -applicationId。

【其他监控工具】

1. Nmon (http://www.ibm.com/developerworks/aix/library/au-analyze_aix/)

Nmon 输入:c:CPU n:网络 m:内存 d:磁盘

Spark性能调优

2. Jmeter (http://jmeter. apache.org/)

通常使用Jmeter做系统性能参数的实时展示,JMeter的安装非常简单,从官方网站上下载,解压之后即可使用。运行命令在%JMETER_HOME%/bin下,对于 Windows 用户,直接使用jmeter.bat。

启动jmeter:创建测试计划,设置线程组设置循环次数。

添加监听器:jp@gc - PerfMon Metrics Collector。

Spark性能调优

设置监听器:监听主机端口及监听内容,例如CPU。

Spark性能调优

启动监听:可以实时获得节点的CPU状态信息,从图4可看出CPU已出现瓶颈。

Spark性能调优

3. Jprofiler (http://www.ej-technologies.com/products/jprofiler/overview.html)

JProfiler是一个全功能的Java剖析工具(profiler),专用于分析J2SE和J2EE应用程式。它把CPU、线程和内存的剖析 组合在一个强大的应用中。JProfiler的GUI可以更方便地找到性能瓶颈、抓住内存泄漏(memory leaks),并解决多线程的问题。例如分析哪个对象占用的内存比较多;哪个方法占用较大的CPU资源等;我们通常使用Jprofiler来监控 Spark应用在local模式下运行时的性能瓶颈和内存泄漏情况。

Spark性能调优

上述几个工具可以直接通过提供的链接了解详细的使用方法。

Spark调优

【Spark集群并行度】

在Spark集群环境下,只有足够高的并行度才能使系统资源得到充分的利用,可以通过修改spark-env.sh来调整Executor的数量和使用资源,Standalone和YARN方式资源的调度管理是不同的。

在Standalone模式下:

1. 每个节点使用的最大内存数:SPARK_WORKER_INSTANCES*SPARK_WORKER_MEMORY;

2. 每个节点的最大并发task数:SPARK_WORKER_INSTANCES*SPARK_WORKER_CORES。

在YARN模式下:

1. 集群task并行度:SPARK_ EXECUTOR_INSTANCES* SPARK_EXECUTOR_CORES;

2. 集群内存总量:(executor个数) * (SPARK_EXECUTOR_MEMORY+ spark.yarn.executor.memoryOverhead)+ (SPARK_DRIVER_MEMORY+spark.yarn.driver.memoryOverhead)。

重点强调:Spark对Executor和Driver额外添加堆内存大小,Executor端:由 spark.yarn.executor.memoryOverhead设置,默认值executorMemory * 0.07与384的最大值。Driver端:由spark.yarn.driver.memoryOverhead设置,默认值driverMemory * 0.07与384的最大值。

通过调整上述参数,可以提高集群并行度,让系统同时执行的任务更多,那么对于相同的任务,并行度高了,可以减少轮询次数。举例说明:如果一个stage有100task,并行度为50,那么执行完这次任务,需要轮询两次才能完成,如果并行度为100,那么一次就可以了。

但是在资源相同的情况,并行度高了,相应的Executor内存就会减少,所以需要根据实际实况协调内存和core。此外,Spark能够非常有 效的支持短时间任务(例如:200ms),因为会对所有的任务复用JVM,这样能减小任务启动的消耗,Standalone模式下,core可以允许 1-2倍于物理core的数量进行超配。

【Spark任务数量调整】

Spark的任务数由stage中的起始的所有RDD的partition之和数量决定,所以需要了解每个RDD的partition的计算方 法。以Spark应用从HDFS读取数据为例,HadoopRDD的partition切分方法完全继承于MapReduce中的 FileInputFormat,具体的partition数量由HDFS的块大小、mapred.min.split.size的大小、文件的压缩方式 等多个因素决定,详情需要参见FileInputFormat的代码。

【Spark内存调优】

内存优化有三个方面的考虑:对象所占用的内存,访问对象的消耗以及垃圾回收所占用的开销。

1. 对象所占内存,优化数据结构

Spark 默认使用Java序列化对象,虽然Java对象的访问速度更快,但其占用的空间通常比其内部的属性数据大2-5倍。为了减少内存的使用,减少Java序列 化后的额外开销,下面列举一些Spark官网(http://spark.apache.org/docs/latest /tuning.html#tuning-data-structures)提供的方法。

(1)使用对象数组以及原始类型(primitive type)数组以替代Java或者Scala集合类(collection class)。fastutil 库为原始数据类型提供了非常方便的集合类,且兼容Java标准类库。

(2)尽可能地避免采用含有指针的嵌套数据结构来保存小对象。

(3)考虑采用数字ID或者枚举类型以便替代String类型的主键。

(4)如果内存少于32GB,设置JVM参数-XX:+UseCom­pressedOops以便将8字节指针修改成4字节。与此同时,在 Java 7或者更高版本,设置JVM参数-XX:+UseC­­­­­ompressedStrings以便采用8比特来编码每一个ASCII字符。

2. 内存回收

(1)获取内存统计信息:优化内存前需要了解集群的内存回收频率、内存回收耗费时间等信息,可以在spark-env.sh中设置 SPARK_JAVA_OPTS=“-verbose:gc -XX:+PrintGCDetails -XX:+PrintGCTimeStamps $ SPARK_JAVA_OPTS”来获取每一次内存回收的信息。

(2)优化缓存大小:默认情况Spark采用运行内存(spark.executor.memory)的60%来进行RDD缓存。这表明在任务执 行期间,有40%的内存可以用来进行对象创建。如果任务运行速度变慢且JVM频繁进行内存回收,或者内存空间不足,那么降低缓存大小设置可以减少内存消 耗,可以降低spark.storage.memoryFraction的大小。

3. 频繁GC或者OOM

针对这种情况,首先要确定现象是发生在Driver端还是在Executor端,然后在分别处理。

Driver端:通常由于计算过大的结果集被回收到Driver端导致,需要调大Driver端的内存解决,或者进一步减少结果集的数量。

Executor端:

(1)以外部数据作为输入的Stage:这类Stage中出现GC通常是因为在Map侧进行map-side-combine时,由于group 过多引起的。解决方法可以增加partition的数量(即task的数量)来减少每个task要处理的数据,来减少GC的可能性。

(2)以shuffle作为输入的Stage:这类Stage中出现GC的通常原因也是和shuffle有关,常见原因是某一个或多个group 的数据过多,也就是所谓的数据倾斜,最简单的办法就是增加shuffle的task数量,比如在SparkSQL中设置SET spark.sql.shuffle.partitions=400,如果调大shuffle的task无法解决问题,说明你的数据倾斜很严重,某一个 group的数据远远大于其他的group,需要你在业务逻辑上进行调整,预先针对较大的group做单独处理。

【修改序列化】

使用Kryo序列化,因为Kryo序列化结果比Java标准序列化更小,更快速。具体方法:spark-default.conf 里设置spark.serializer为org.apache.spark.serializer.KryoSerializer 。

参考官方文档(http://spark.apache.org/docs/latest/tuning.html#summary):对于大多数程序而言,采用Kryo框架以及序列化能够解决性能相关的大部分问题。

【Spark 磁盘调优】

在集群环境下,如果数据分布不均匀,造成节点间任务分布不均匀,也会导致节点间源数据不必要的网络传输,从而大大影响系统性能,那么对于磁盘调优最好先将数据资源分布均匀。除此之外,还可以对源数据做一定的处理:

1. 在内存允许范围内,将频繁访问的文件或数据置于内存中;

2. 如果磁盘充裕,可以适当增加源数据在HDFS上的备份数以减少网络传输;

3. Spark支持多种文件格式及压缩方式,根据不同的应用环境进行合理的选择。如果每次计算只需要其中的某几列,可以使用列式文件格式,以减少磁盘I/O, 常用的列式有parquet、rcfile。如果文件过大,将原文件压缩可以减少磁盘I/O,例如:gzip、snappy、lzo。

【其他】

广播变量(broadcast)

当task中需要访问一个Driver端较大的数据时,可以通过使用SparkContext的广播变量来减小每一个任务的大小以及在集群中启动 作业的消耗。参考官方文档http://spark.apache.org/docs/latest /tuning.html#broadcasting-large-variables。

开启推测机制

推测机制后,如果集群中,某一台机器的几个task特别慢,推测机制会将任务分配到其他机器执行,最后Spark会选取最快的作为最终结果。

在spark-default.conf 中添加:spark.speculation true

推测机制与以下几个参数有关:

1. spark.speculation.interval 100:检测周期,单位毫秒;

2. spark.speculation.quantile 0.75:完成task的百分比时启动推测;

3. spark.speculation.multiplier 1.5:比其他的慢多少倍时启动推测。

总结

Spark系统的性能调优是一个很复杂的过程,需要对Spark以及Hadoop有足够的知识储备。从业务应用平台(Spark)、存储 (HDFS)、操作系统、硬件等多个层面都会对性能产生很大的影响。借助于多种性能监控工具,我们可以很好地了解系统的性能表现,并根据上面介绍的经验进 行调整。

作者简介:田毅,亚信科技大数据平台部门研发经理,Spark Contributor,北京Spark Meetup发起人,主要关注SparkSQL与Spark Streaming。

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